La Iglesia de Scientology de Portugal fue establecida en 1984 e inscrita como una entidad religiosa sin ánimo de lucro el 7 de abril de 1988 por el Ministerio de Justicia. Como tal, está exenta de impuestos. Además la ley que rige las inscripciones y la categoría de entidad religiosa, cambió recientemente en Portugal, tratandose de una ley mucho más concreta y estricta, y tras pasar los nuevos criterios, el 18 Septiembre 2007, el Ministerio de Justicia Portugués concedió  el nuevo status de entidad religiosa para la Igreja Portuguesa de Cientología.